I frøhvelvet ligger mange titalls tusen varianter av viktige matplanter som bønner, hvete og ris. Disse frøprøvene er kopi av frøprøver som ligger lagret i nasjonale, regionale og internasjonale genbanker.
I Frøportalen til NordGen er det en oppdatert oversikt over alle frø som er deponert i Svalbard Globale frøhvelv.
Frøhvelvet er ingen vanlig genbank som forskere og andre kan henvende seg direkte til for å tilgang til frøene. Det er de mange nasjonale, regionale og internasjonale frøsamlingene og genbankene rundt om i verden, som i første rekke forsyner jordbruket med nytt genetisk mangfold. Frøhvelvet på Svalbard er et sikkerhetslager for disse samlingene, som kan brukes til å gjenskape verdifulle varianter av planter hvis frøsamlingene i en vanlig genbank skulle gå tapt.